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查看NextSeq 1000/1000-CN和NextSeq 2000/2000-CN测序系统的规格，从零开始重新设计，满足不断发展的需求
每个流动槽的测序产出*
NextSeq 1000/1000-CN和NextSeq 2000/2000-CN
| 流动槽类型 | P1 | P2 | P3 † |
|---|---|---|---|
| 1 × 50 bp | 60 Gb | ||
| 2 × 50 bp | 10 Gb | 40 Gb | 120 Gb |
| 2 × 100 bp | 80 Gb | 240 Gb | |
| 2 × 150 bp | 30 Gb | 120 Gb | 360 Gb |
| 2 × 300 bp | 60 Gb | 180 Gb (300 M) |
* 输出规格基于单个流动槽，使用Illumina PhiX对照文库，在支持的簇密度下产出进行计算。
† P3试剂仅适用于NextSeq 2000/2000-CN系统。
保质期
NextSeq 1000/1000-CN和NextSeq 2000/2000-CN
| 条目 | 储存温度 | 保质期 |
|---|---|---|
| 卡盒 | -25°C至-15°C | 6个月 |
| 流动槽 | 2°C至8°C | 6个月 |
| RSB（含Tween 20）* | 2°C至8°C | 6个月 |
* 室温下运输
每个流动槽通过过滤的read
NextSeq 1000/1000-CN和NextSeq 2000/2000-CN
| 流动槽类型 | P1 | P2 | P3 * |
|---|---|---|---|
| 单端reads | 100M | 400M † | 1.2B |
| 双端reads | 200M | 800M ‡ | 2.4B |
* P3试剂仅适用于NextSeq 2000/2000-CN系统。
† 对于2 × 300 bp的测序深度，为300M单端reads。
‡ 对于2 × 300 bp的测序深度，600M双端reads。
质量分值*与运行时间†
NextSeq 1000/1000-CN和NextSeq 2000/2000-CN
| 流动槽类型 | P1 | P2 | P3 ‡ |
|---|---|---|---|
| 质量分值 | |||
| 1 × 50 bp | 在1 × 50 bp时，≥ 90%的碱基分值高于Q30 | ||
| 2 × 50 bp | 在2 × 50 bp时，≥ 90%的碱基分值高于Q30 | ||
| 2 × 100 bp | 在2 × 100 bp时，≥ 85%的碱基分值高于Q30 | ||
| 2 × 150 bp | 在2 × 150 bp时，≥ 85%的碱基分值高于Q30 | ||
| 2 × 300 bp | 在2 × 300 bp时，≥ 80%的碱基分值高于Q30 | ||
| 运行时间 | |||
| 1 × 50 bp | 约11小时 | ||
| 2 × 50 bp | 约10小时 | 约13小时 | 约19小时 |
| 2 × 100 bp | 约21小时 | 约33小时 | |
| 2 × 150 bp | 约19小时 | 约29小时 | 约48小时 |
| 2 × 300 bp | 约34小时 | 约44小时 | |
* 质量分值（Q值）是对碱基检出中错误发生几率的预测。＞Q30的碱基百分比根据整个运行中的数据取平均值。质量分值是基于NextSeq试剂盒在NextSeq 1000/1000-CN和NextSeq 2000/2000-CN系统上的运行所计算的，利用了Illumina PhiX对照文库。根据文库类型和质量、插入片段大小、上样浓度及其他实验因素的不同，性能表现可能有所差异。
† 运行时间包括NextSeq 1000/1000-CN或NextSeq 2000/2000-CN系统上的簇生成、测序和碱基检出。
‡ P3试剂仅适用于NextSeq 2000/2000-CN系统。
对关键应用估计的样本通量*
NextSeq 1000/1000-CN和NextSeq 2000/2000-CN
| 流动槽类型 | P1 | P2 | P3 † |
|---|---|---|---|
|
小型全基因组测序（300个循环） 130 Mb基因组；覆盖度大于30倍 |
~7 | ~30 | ~90 |
|
小型全基因组测序（600个循环） 130 Mb基因组；覆盖度大于30倍 |
~12 | ~36 | ~ |
|
全外显子组测序（200个循环） 平均目标区域覆盖度为50倍；90%的目标区域覆盖度为20倍 |
~4‡ | ~16 | ~48 |
|
总RNA-Seq（200个循环） § 每个样本50M read对 |
~2‡ | ~16 | ~24 |
|
mRNA-Seq（200个循环）§ 每个样本25M read对 |
~4‡ | ~32 | ~48 |
|
单细胞RNA-Seq（100个循环）** 5K细胞，20K reads/细胞 |
1†† | ~4 | ~11 |
|
miRNA-Seq或小RNA分析（50个循环） 11M reads/样本 |
~9‡‡ | 36§§ | ~108 |
| 16S RNA测序（600个循环） | ~384*** | ~384*** | ~ |
* 表格数据代表每次运行预计样本数。
† P3试剂仅适用于NextSeq 2000/2000-CN系统。
‡ 使用P1 300个循环试剂盒。
§ 对于Illumina Stranded Total RNA Prep和Illumina Stranded mRNA Prep，建议读长是2 × 75 bp，对于Illumina RNA Prep with Enrichment建议读长是2 × 100 bp。
** 建议的测序深度在很大程度上取决于样本类型和实验目标，需要针对每项研究进行优化。
†† P1试剂是单细胞质量控制实验的好选择。
‡‡ 使用P1 100个循环试剂盒。
§§ 使用P2 100个循环试剂盒。
*** 因美纳提供最多384个唯一双标签序列。
Sequencing output per flow cella
NextSeq 1000 and NextSeq 2000
| Flow cell type | P1b | P2b | P3b,c | P4c |
|---|---|---|---|---|
| 1 × 50 bp | 90 Gb | |||
| 2 × 50 bp | 10 Gb | 40 Gb | 120 Gb | 180 Gb |
| 2 × 100 bp | 80 Gb | 240 Gb | 360 Gb | |
| 2 × 150 bp | 30 Gb | 120 Gb | 360 Gb | 540 Gb |
| 2 × 300 bp | 60 Gb | 240 Gb |
a. Output specifications are based on an Illumina PhiX control library at supported cluster densities.
b. XLEAP-SBS reagents for P1, P2, and P3 flow cells available Q2 of 2024.
c. P3 and P4 reagents are available for the NextSeq 2000 System only.
Shelf life
NextSeq 1000 and NextSeq 2000
| Item | Storage Temperature | P1, P2, P3 Shelf Lifea | P4 Shelf Lifeb |
|---|---|---|---|
| Cartridge | -25°C to -15°C | 6 months | 3 months |
| Flow Cell | 2°C to 8°C | 6 months | 3 months |
| RSB with Tween 20c | 2°C to 8°C | 6 months | 6 months |
a. P1, P2, and P3 with XLEAP-SBS chemistry will launch in Q2 of 2024 with a shelf life of 6 months.
b. In 1H of 2024, P4 shelf life will be 3 months. This will be extended to 6 months in 2H of 2024.
c. Shipped at room temperature.
Reads passing filter per flow cell
NextSeq 1000 and NextSeq 2000 with XLEAP-SBS chemistry
| Flow Cell Type | P1a | P2a | P3a,b | P4b |
|---|---|---|---|---|
| Single-end Reads | 100M | 400M c | 1.2B | 1.8B |
| Paired-end Reads | 200M | 800M d | 2.4B | 3.6B |
a. XLEAP-SBS reagents for P1, P2, and P3 flow cells available Q2 of 2024.
b. P3 and P4 reagents are available for the NextSeq 2000 System only.
c. 300M single-end reads for 2 × 300 bp with standard SBS chemistry. 400M single-ends reads for 2 x 300 bp with XLEAP-SBS chemistry.
d. 600M paired-end reads for 2 × 300 bp with standard SBS chemistry. 800M single-ends reads for 2 x 300 bp with XLEAP-SBS chemistry.
Quality scores and run time
NextSeq 1000 and NextSeq 2000 with XLEAP-SBS chemistry
| Flow cell type | P1a | P2a | P3a,b | P4b |
|---|---|---|---|---|
| Quality scoresc | ||||
| 1 × 50 bp | ≥ 90% of bases higher than Q30 | |||
| 2 × 50 bp | ≥ 90% of bases higher than Q30 | |||
| 2 × 100 bp | ≥ 90% of bases higher than Q30 | |||
| 2 × 150 bp | ≥ 90% of bases higher than Q30 | |||
| 2 × 300 bp | ≥ 85% of bases higher than Q30 | |||
| Run timed | ||||
| 1 × 50 bp | 12 hr | |||
| 2 × 50 bp | 8 hr | 12 hr | 18 hr | 20 hr |
| 2 × 100 bp | 19 hr | 31 hr | 34 hr | |
| 2 × 150 bp | 17 hr | 22 hr | 40 hr | 44 hr |
| 2 × 300 bp | 34 hr | 42 hr | ||
a. XLEAP-SBS reagents for P1, P2, and P3 flow cells available Q2 of 2024.
b. P3 and P4 reagents are available for the NextSeq 2000 System only.
c. Quality scores are based on an Illumina PhiX control library; performance may vary based on library type and quality, insert size, loading concentration, and other experimental factors.
d. Run time includes cluster generation, sequencing, and base calling on a NextSeq 1000 or NextSeq 2000 System.
Estimated sample throughput for key applicationsa
NextSeq 1000 and NextSeq 2000 with XLEAP-SBS chemistry
| Flow Cell Type | P1b | P2b | P3b,c | P4c |
|---|---|---|---|---|
|
Small Whole-Genome Sequencing (300 cycles) 130 Mb genome; > 30× coverage |
7 | 30 | 92 | 138 |
|
Whole-Exome Sequencing (200 cycles) ~8 Gb per exome, 90× mean coverage |
~2d | 10 | 30 | 45 |
|
Total RNA-Seq (200 cycles) 50M read pairs per sample |
2d | 8 | 24 | 36 |
|
mRNA-Seq (200 cycles) 25M read pairs per sample |
4d | 16 | 48 | 72 |
|
Single-Cell RNA-Seq (100 cycles) 5K cells, 20K reads/sample |
1e | 4 | 12 | 48 |
|
miRNA-Seq or Small RNA Analysis (50 cycles) 11M reads/sample |
9f | 36f | 108f | 163 |
| 16S RNA sequencing (600 cycles) | 384g | 384g |
a. Table values represent estimated number of samples per run. Recommended sequencing depth will largely depend on sample type and experimental objective and will need to be optimized for each study.
b. XLEAP-SBS reagents for P1, P2, and P3 flow cells available Q2 of 2024.
c. P3 and P4 reagents are available for the NextSeq 2000 System only.
d. Use P1 300-cycle kit.
e. P1 reagents are a good option for single-cell quality control experiments.
f. Use 100-cycle kits.
g. A maximum of 384 unique dual indexes is available from Illumina.
NextSeq 1000/1000-CN和NextSeq 2000/2000-CN
仪器规格表
仪器配置
-
具有集成式DRAGEN Bio-IT FPGA二级分析的独立干燥仪器
仪器控制计算机
操作环境
激光
尺寸
包装尺寸
电源要求
网络连接带宽
产品安全与合规
-
安全性：1级激光产品
-
NRTL认证IEC
-
61010-1 CE认证
-
FCC/IC批准
-
内部网络上传速度：200 Mb/s/仪器
-
BaseSpace Sequence Hub上传速度：200 Mb/s/仪器
-
仪器操作数据上传速度：5 Mb/s/仪器
-
仪器输入电压：100 V到240 V交流电
-
仪器输入频率：50/60 Hz
-
包装宽×深×高：92 cm × 120 cm × 118 cm
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毛重：232 kg
-
宽ｘ深ｘ高：60 cm × 65 cm × 60 cm
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重量：141 kg
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波长：449 nm、523 nm、820 nm
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温度：15°C-30°C
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湿度：相对湿度20%–80%，非冷凝
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海拔：0–2000米
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仅供室内使用
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主机：位于仪器内部的2U微型服务器
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内存：288 GB
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硬盘：3.8 TB SSD
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操作系统：Linux CentOS 7.6
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